Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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TM2D3Q9BRN9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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TM2D3Q9BRN9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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TM2D3Q9BRN9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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TM2D3Q9BRN9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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TM2D3Q9BRN9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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TM2D3Q9BRN9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TM2D3Q9BRN9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TM2D3Q9BRN9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TM2D3Q9BRN9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TM2D3Q9BRN9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TM2D3Q9BRN9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TM2D3Q9BRN9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TM2D3Q9BRN9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TM2D3Q9BRN9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TM2D3Q9BRN9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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