Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms