Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms