Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GAL3ST1Q99999 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms