Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms