Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORT1Q99523 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms