Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms