Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms