Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3IPQ96QF0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms