Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms