Protein–RNA interactions for Protein: Q96LI9

CXorf58, Putative uncharacterized protein CXorf58, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf58Q96LI9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms