Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms