Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms