Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
BCANQ96GW7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BCANQ96GW7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms