Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MVB12AQ96EY5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MVB12AQ96EY5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MVB12AQ96EY5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MVB12AQ96EY5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MVB12AQ96EY5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MVB12AQ96EY5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MVB12AQ96EY5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MVB12AQ96EY5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MVB12AQ96EY5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MVB12AQ96EY5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MVB12AQ96EY5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MVB12AQ96EY5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MVB12AQ96EY5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
MVB12AQ96EY5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MVB12AQ96EY5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms