Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms