Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms