Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRIM52Q96A61 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms