Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms