Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms