Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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