Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CNBD1Q8NA66 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CNBD1Q8NA66 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CNBD1Q8NA66 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CNBD1Q8NA66 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNBD1Q8NA66 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNBD1Q8NA66 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNBD1Q8NA66 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNBD1Q8NA66 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNBD1Q8NA66 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNBD1Q8NA66 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms