Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC33Q8N5R6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC33Q8N5R6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC33Q8N5R6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC33Q8N5R6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC33Q8N5R6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC33Q8N5R6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC33Q8N5R6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC33Q8N5R6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC33Q8N5R6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC33Q8N5R6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC33Q8N5R6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC33Q8N5R6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC33Q8N5R6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC33Q8N5R6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC33Q8N5R6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC33Q8N5R6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC33Q8N5R6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC33Q8N5R6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC33Q8N5R6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC33Q8N5R6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC33Q8N5R6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC33Q8N5R6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC33Q8N5R6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC33Q8N5R6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC33Q8N5R6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC33Q8N5R6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC33Q8N5R6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC33Q8N5R6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC33Q8N5R6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC33Q8N5R6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC33Q8N5R6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms