Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms