Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms