Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NME9Q86XW9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NME9Q86XW9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NME9Q86XW9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NME9Q86XW9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NME9Q86XW9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NME9Q86XW9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NME9Q86XW9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NME9Q86XW9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NME9Q86XW9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NME9Q86XW9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NME9Q86XW9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NME9Q86XW9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NME9Q86XW9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NME9Q86XW9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NME9Q86XW9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NME9Q86XW9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NME9Q86XW9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NME9Q86XW9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NME9Q86XW9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NME9Q86XW9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NME9Q86XW9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NME9Q86XW9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NME9Q86XW9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NME9Q86XW9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NME9Q86XW9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NME9Q86XW9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NME9Q86XW9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NME9Q86XW9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms