Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIBP1Q86W92 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms