Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR62

RTL4, Retrotransposon Gag-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL4Q6ZR62 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL4Q6ZR62 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms