Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms