Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMBR1LQ6UX01 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms