Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms