Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF544Q6NX49 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.9 ms