Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms