Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CLQ60I27 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms