Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms