Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF3Q5VWG9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF3Q5VWG9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms