Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms