Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
L1TD1Q5T7N2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1TD1Q5T7N2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms