Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0N1

CFAP70, Cilia- and flagella-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP70Q5T0N1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP70Q5T0N1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CFAP70Q5T0N1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP70Q5T0N1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP70Q5T0N1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP70Q5T0N1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP70Q5T0N1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP70Q5T0N1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP70Q5T0N1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP70Q5T0N1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP70Q5T0N1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP70Q5T0N1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP70Q5T0N1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP70Q5T0N1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP70Q5T0N1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP70Q5T0N1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP70Q5T0N1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP70Q5T0N1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP70Q5T0N1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP70Q5T0N1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP70Q5T0N1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP70Q5T0N1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFAP70Q5T0N1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFAP70Q5T0N1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFAP70Q5T0N1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFAP70Q5T0N1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFAP70Q5T0N1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFAP70Q5T0N1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFAP70Q5T0N1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFAP70Q5T0N1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFAP70Q5T0N1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms