Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
FRMPD1Q5SYB0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms