Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC39AQ5SRH9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC39AQ5SRH9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC39AQ5SRH9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC39AQ5SRH9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC39AQ5SRH9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC39AQ5SRH9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC39AQ5SRH9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC39AQ5SRH9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC39AQ5SRH9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC39AQ5SRH9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC39AQ5SRH9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC39AQ5SRH9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC39AQ5SRH9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC39AQ5SRH9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms