Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms