Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms