Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms