Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KHDC3LQ587J8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms