Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LONRF3Q496Y0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LONRF3Q496Y0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LONRF3Q496Y0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LONRF3Q496Y0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LONRF3Q496Y0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LONRF3Q496Y0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LONRF3Q496Y0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LONRF3Q496Y0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LONRF3Q496Y0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LONRF3Q496Y0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LONRF3Q496Y0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LONRF3Q496Y0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LONRF3Q496Y0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LONRF3Q496Y0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LONRF3Q496Y0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LONRF3Q496Y0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LONRF3Q496Y0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LONRF3Q496Y0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LONRF3Q496Y0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LONRF3Q496Y0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LONRF3Q496Y0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LONRF3Q496Y0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LONRF3Q496Y0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LONRF3Q496Y0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LONRF3Q496Y0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LONRF3Q496Y0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LONRF3Q496Y0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LONRF3Q496Y0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LONRF3Q496Y0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms