Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCGF3Q3KNV8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms