Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms