Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FHOD3Q2V2M9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FHOD3Q2V2M9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FHOD3Q2V2M9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FHOD3Q2V2M9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
FHOD3Q2V2M9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FHOD3Q2V2M9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
FHOD3Q2V2M9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FHOD3Q2V2M9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
FHOD3Q2V2M9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
FHOD3Q2V2M9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FHOD3Q2V2M9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FHOD3Q2V2M9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FHOD3Q2V2M9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FHOD3Q2V2M9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FHOD3Q2V2M9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FHOD3Q2V2M9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FHOD3Q2V2M9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FHOD3Q2V2M9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FHOD3Q2V2M9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FHOD3Q2V2M9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FHOD3Q2V2M9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FHOD3Q2V2M9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FHOD3Q2V2M9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FHOD3Q2V2M9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FHOD3Q2V2M9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FHOD3Q2V2M9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FHOD3Q2V2M9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
FHOD3Q2V2M9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms