Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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